Los pretendientes al trono son dos :Jaume II, conde de Urgell, governador general de la corona,  biznieto del rey Alfons II y Fernando de Antequera, de la familia castellana Trastamara, hijo de Juan I de Castilla, y de su esposa Leonor de Aragón,  quien reclama su derecho a ser rey en virtud de ser nieto del rey Pere III 
Las tropas del Trastamara estan posicionadas en Aragón y Valencia, eso influye en los compromisarios y los Compromisarios eligen al Trastamara.
Jaume d'Urgell se rebela militarmente y comenza la guerra civil catalana que termina con su rendición y puesta en prisión en el castillo de Xàtiva

Muchos nobles catalanes pierden sus tierras y el nuevo rey las adjudica a nobles castellanos.  Por ejemplo D Cristobal Colom, señor de Tarroja de Segarra las pierde a favor de Francisco de Bobadilla o el señor de Cervera que pierde el castillo de La Rapita, a favor de los Vega de León.(parientes de  Iñigo López de Mendoza, conocido literariamente como " Marqués de Santillana" y de Lluís de la Cerda, duque de Medinaceli.

En 1413, después del compromiso de Caspe, el candidato catalán Jaume de Urgell, no acata el compromiso y se rebela militarmente contra el nuevo rey Ferran I, d'Antequera. estableciendo su cuartel general  en el castillo de la Rapita de Balaguer. 
Jaume d'Urgell es apoyado por varios nobles catalanes, entre los que destacan Cristóbal Colom, hombre muy rico de Tarroja ( Terra-Rubra) de Segarra y el noble militar Bernat Joan de Caçinera, señor de el Canós.. 
Jaume de Urgell, pierde la guerra y es hecho prisionero.  El rey incauta las tierras de Cristóbal Colom y posteriormente se las otorga al noble castellano Bobadilla, que le había apoyado con armas y hombres. Y el castillo de la Rapita el rey lo incauta a Jaume de Cervera, y lo dona a los Vega de León. ( antepasados del Marques de Santillana y de Luis de la Cerda )

Pedro de Coimbra murió en la Batalla. Su esposa Isabel de Urgell, hija de Jaume d'Urgell, tiene que refugiarse con sus hijas de monasterio en monasterio. Esas dos hijas pequeñas se llaman  Felipa y Beatriz, Los otros cuatro hijos de Pedro e Isabel fueron Isabel , Beatriz, Pedro, Juan y Jaime.
Pedro fue rey de los Catalanes de (1463-1466), Juan caso con la reina de Xipre, e Ysabel casó con Alfonso V  Rey de Portugal.

Le sucede su hermano, Juan II, rey de Navarra, que ya ejercia de "Lloctinent de Catalunya" desde 1454, dada la ausencia del rey, y no era muy apreciado por la población.
En 1452 nace Ferran II, hijo de Juan II de Aragón y de su segunda esposa, Juana Enriquez.( hija del Almirante de Castilla, Fadrique Enriquez )   Juana Enriquez presionaba al rey para que desheredara al principe Carlos de VIana, hijo del rey y de su anterior esposa, Blanca de Navarra, y nombrara sucesor a su hijo Ferran.
La oposición a Joan II es debida a los pleitos de este con su hijo Carles de Viana, hijo de Blanca de Navarra, el cual, desposeido por su padre de este reino, se habia refugiado en la corte del Rey Alfons IV en Mapoles, el cual le habia designado sucesor de Joan en su testamento. y despues de la muerte del rey, se refugia en Mallorca.
Joan II le deseaba casar con Isabel de Castilla, pero el desembarco de Carles en Barcelona, donde fue recibido por la población entusiasticamente, provoca que el rey lo encarcelé en 1460.
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La indignación que produce en Catalunya hace que la Generalitat, dado que el rey habia incumplido las leyes, exija al rey Joan II el nombramiento de heredero a favor de Carlos,  La Generalitat se enfrenta al rey, y el rey Juan II capitula en Febrero de 1461 en la Concordia de Vilafranca. Carlos es nombrado sucesor.  El firmante del acuerdo por parte de la Generalitat es Jaume-Joan Colom i Marimón  Este acuerdo prohibía al rey pisar Catalunya sin autorización de la Generalitat. 

El principe murió el 23 de septiembre de 1461 de un supuesto "mal de costado" ( pleuresia) despues de cenar en el Monasterio de Pedralbes con Isabel de Aragón, su hermanastra.

La Generalitat, ofreció la corona a Enrique de Castilla (1462-1463).

En Junio del 1463, las tropas de la Generalitat, dirigidas por el Compte de Pallars y Lluis Colom Bertran bombardean la ciudad de Girona durante siete semanas.  El objetivo era llevarse la reina y el príncipe ( Ferran ) a Barcelona. 

En 1464, la Generalitat nombra president para el siguiente trienio a Francesc Joan Colom i Bertran. ( president nº 29 )     El y sus hermanos Lluis, Guillem-Joan, Joan (marino), Jaume ( Diogo en portugues),
.dirigieron la Generalitat en la guerra civil contra el rey Juan II.

Despues la Generalitat coronó rey a Pedro de Portugal (1464-1466)  que era descendiente de Jaume II d'Urgell (falleció en Granollers en Junio de 1466 ).  La comitiva funebre que trasladó su cuerpo de Granollers a Barcelona, era presidida por Mossen Francesc Colom.

28 de Febrero de 1465,  batalla de Gélida entre el rey Juan II contra el rey Pere IV  y la Generalitat   La batalla la gana el rey Juan II . Es hecho prisionero Rodrigo de Bobadilla, que luchaba a favor del rey Juan II. El rey Pere IV murió en Granollers en 1466.

El 10 de Octubre de 1472, fallece Francesc Joan Colom i Bertran, 6 días antes de la Capitulación de Pedralbes. Finalmente el 16 de Octubre de 1472 se acuerda la paz, aprobandose toda la actuación de la Generalitat, y jurando de nuevo el rey las Constituciones de Catalunya. Una vez terminada la guerra civil, el rey Juan II, conmina a Miquel Colom, Guillem-Joan Colom  Bertran, Galceran Colom  Dusay y Guillem Colom a cesar sus hostilidades contra los Boscá y los Farrreres. 

 Lluis Colom i Bertran no acepta el pacto y emigra con su segunda esposa a Sicilia.  Después de 1477 se casó con Elionor Serra. Desapareció o fue dado por muerto en 1492 embargando la corona sus bienes.

Joan Colom, Almirante de la Generalitat, continuó la lucha por mar contra Joan II de 1472 a 1474 después de la capitulación. a las ordenes del Rei Rainer. Despues desapareció.

El Rosselló y los territorios cedidos por la hipoteca de Joan II a Francia no fueron recuperados hasta 1493.

Alfonso murió el 5 de Julio de 1468. Entonces varias cuidades proclamaron reina a Isabel, pero otras se mantuvieron fieles a Enrique. Mediante el acuerdo de los Toros de Guisando Enrique quedó como unico rey e Isabel coo heredera.

A la muerte de Enrique en 1474 un sector de la nobleza proclamó reina a Juana y otro 
en 1475 roclamó reyes de Castilla. a Isabel  y Ferran V y estalló la guerra civil.
Isabel apoyada por su marido Ferran (heredero de Catalunya-Aragón) y Juana apoyada por el rey Alfonso V de Portugal 
Ferran II derrota el 24 de Febrero de 1479 a Alfonso V de Portugal y Juana la Beltraneja, con lo cual  se aseguraba el gobierno de Castilla.

Juana serà recluida en un monasterio portugues ( Clarisas de Coimbra ) hasta su muerte

Pese a que la sentencia arbitral de Guadalupe, dictada por Ferran II  beneficiaba a los remences, el remensa Joan de Canyamars atentó contra el rey.

Todo el siglo se caracteriza en Catalunya por estar permanentemente en guerra: contra el rey por defender los derechos y libertades, entre terratenientes y remensas y entre los dos partidos de Barcelona, la Busca y la Biga, permanentemente enfrentados.
Ferran se aprovecha de ese debilitamiento cambiando hasta el modo de elegir President de la Generalitat, y se inventa la "insaculación" que consiste en la elección a suertes del President de entre una lista previamente realizada por el rey. Cambió la democracia mas avanzada de Europa por una "democracia organica".
Mas tarde cuando muere Isabel y vuelve a Catalunya intenta enmendar todo lo realizado, casandose con Germana de Foix para conseguir un heredero de la Corona Catalana, pero el hijo nacido de ambos murió.